24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0621 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  299  8.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  39.1 
 
 		 148 aa  87  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  29.73 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2035  PilT domain-containing protein  39.42 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3324  PilT protein-like  36.23 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.108302  normal  0.226575 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0658  PilT protein domain protein  35.59 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0680222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1581  PilT protein domain protein  32.09 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  32.33 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  32.37 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  34.35 
 
 		 152 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3724  PilT protein-like  34.15 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  35.71 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4646  PilT protein domain protein  28.36 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000332576  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  30.43 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2205  PilT protein-like  32.82 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.682603  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1564  PilT protein domain protein  27.91 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  40.26 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3531  PilT protein-like  29.13 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0067  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2149  PilT protein-like  27.82 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1387  PilT protein-like  30.53 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.325205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0899  PilT protein-like  42 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1690  hypothetical protein  35.96 
 
 		 147 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1683  hypothetical protein  35.96 
 
 		 147 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.523033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>