33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1114 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  100 
 
 		 100 aa  207  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  42.05 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  41.11 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  43.48 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  36.08 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  41.25 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  33.72 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  48.1 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0621  PilT domain-containing protein  40.26 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  37.04 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  39.74 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  35.56 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  31.96 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2647  PilT domain-containing protein  35.56 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  47.73 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  32 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  42.86 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  43.4 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  30.91 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  40.32 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  34.26 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  34.62 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  34.62 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  37.7 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  36.23 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  34.62 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3765  PilT protein domain protein  26.32 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  38.71 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  31.94 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  45.45 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  37.7 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  42.55 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>