21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3131 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  100 
 
 
124 aa  247  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2647  PilT domain-containing protein  44.54 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434907  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3765  PilT protein domain protein  37.07 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  39.83 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  38.05 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  35.25 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  34.51 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  33.72 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  32.8 
 
 
158 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  31.97 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  29.73 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  33.64 
 
 
121 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  33.33 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  35.56 
 
 
121 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  30.19 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  26.61 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  32.38 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  29.17 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  35.23 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0272  PilT protein domain protein  37.5 
 
 
153 aa  40.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000977844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>