60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1663 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  100 
 
 		 120 aa  248  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  41.11 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  35.25 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  40.66 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  34.81 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  30.58 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  31.43 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  30.53 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  29.73 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  27.74 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  27.01 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  28.3 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3765  PilT protein domain protein  28.16 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  29.08 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  31.48 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  26.61 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  30.6 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  29.5 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  31.19 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  27.36 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  26.77 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  61.11 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  27.73 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  38.71 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  28.44 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  26.98 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  29.5 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  37.7 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  30.95 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  26.32 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  35.14 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  28.57 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  27.36 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  32.23 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  46.34 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  30.67 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  34.25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  29.51 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  25.37 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  30.67 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  30.67 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  30.67 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  28.06 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  37.7 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  28.7 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  26.85 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  28.7 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  36.07 
 
 		 135 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  29.09 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  33.81 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  26.85 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  30.23 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  41.67 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  31.53 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  27.05 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  27.54 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  26.12 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  25.93 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  27.21 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  30.95 
 
 		 134 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>