132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4336 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  100 
 
 		 141 aa  281  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  56.62 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  52.17 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  52.17 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  52.17 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  54.68 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  53.24 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  52.17 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  50.71 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  49.26 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  47.86 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  46.32 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  47.41 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  43.88 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  46.32 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1397  PilT protein-like  47.01 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00639192  normal  0.0193425 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  46.1 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  41.43 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  46.43 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  42.66 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  43.48 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  44.12 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  43.38 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3420  PilT protein domain protein  43.57 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.753141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  43.57 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  44.12 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  37.06 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  41.18 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  44.37 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  44.37 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  44.37 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  39.16 
 
 		 141 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  37.76 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  39.44 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  41.48 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  34.04 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  39.01 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  37.84 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  39.42 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  36.05 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  36.5 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  35.17 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  37.78 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  44.76 
 
 		 117 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  36.73 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  36.11 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  36.5 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  38.03 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  37.59 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  35.21 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  38.24 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  35 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  37.14 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  37.14 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3556  PilT domain-containing protein  36.69 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9108  pilT protein, N-terminal  33.33 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4712  Serine O-acetyltransferase  38.33 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  34.27 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  34.97 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  31.69 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2018  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0657956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  36.55 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  34.29 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  33.79 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  35.66 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  33.1 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  34.27 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  33.81 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  32.88 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3850  putative plasmid stabilization protein  34.07 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  32.64 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  32.39 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  33.99 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  30.71 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4674  PilT protein domain protein  35.97 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0728  PilT protein domain protein  33.11 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  33.1 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  30.99 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2075  PilT domain-containing protein  34.27 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  30.99 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  37.93 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  29.17 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  34.01 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4334  PilT domain-containing protein  34.75 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1709  PilT protein-like  28.17 
 
 		 164 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  32.41 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  34.27 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  32.86 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  34.48 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  34.04 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  34.04 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  29.93 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  30.34 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  30.5 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3526  PilT domain-containing protein  30.28 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  32.19 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  30.67 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>