181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2505 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  100 
 
 		 142 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  70 
 
 		 147 aa  203  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  63.5 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  40.85 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  45.45 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  38.85 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  41.73 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  40.71 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  35.25 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  37.41 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  35.38 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  38.85 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  38.97 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  38.97 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  40.58 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  38.24 
 
 		 139 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  37.86 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3180  PilT domain-containing protein  41.73 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  36.03 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  39.71 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  38.46 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  36.81 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  38.57 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  35.62 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  35.51 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  34.27 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  36.76 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  33.82 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  35.04 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  37.24 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  35.92 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  36.57 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  38.97 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  35.29 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  36.76 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  36.43 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  33.82 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  39.71 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  39.71 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  36.43 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  35.29 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  34.29 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  36.03 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  36.03 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  32.37 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  37.41 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4674  PilT protein domain protein  38.57 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  31.62 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  33.82 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  37.5 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  36.05 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4151  PilT protein-like  34.51 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0792  nucleic acid binding protein  34.58 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  35 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  34.01 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  36.43 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  36.69 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  36.03 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  35.97 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  34.06 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4334  PilT domain-containing protein  38.97 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  38.17 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0805  PilT protein-like  36.5 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  31.29 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  32.14 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  32.39 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  34.72 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  34.72 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  34.72 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1709  PilT protein-like  33.33 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  36.43 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2075  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  33.8 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  34.27 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  32.33 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0728  PilT protein domain protein  34.56 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  34.97 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  35.21 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3138  PilT protein-like  36.03 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464533  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  32.65 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  34.48 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3420  PilT protein domain protein  31.69 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.753141 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  33.57 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  33.1 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  33.1 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  33.1 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>