138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2075 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2075  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  55 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  53.96 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  56.43 
 
 		 141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  47.14 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  53.28 
 
 		 139 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  53.28 
 
 		 139 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  48.91 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  53.62 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  49.28 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  51.05 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  50 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  50 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  47.89 
 
 		 142 aa  133  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  55.07 
 
 		 144 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  48.91 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  46.38 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4334  PilT domain-containing protein  53.28 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  49.28 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  45.71 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  43.75 
 
 		 159 aa  126  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4674  PilT protein domain protein  48.55 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  47.45 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  51.82 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0728  PilT protein domain protein  51.45 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  43.38 
 
 		 140 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3138  PilT protein-like  51.82 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464533  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  42.65 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  42.14 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  44.2 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  38.73 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  47.83 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  47.83 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  41.3 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  43.48 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  38.41 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  44.53 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0792  nucleic acid binding protein  42.02 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  38.57 
 
 		 139 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  38.85 
 
 		 144 aa  103  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  39.42 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1710  PilT domain-containing protein  43.8 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  41.96 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  37.23 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  39.42 
 
 		 139 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2640  PilT domain-containing protein  39.42 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  42.14 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  42.86 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  39.57 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  38.19 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  37.41 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1876  plasmid stabilization protein StbB-like  39.13 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  45.26 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4151  PilT protein-like  40.15 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0805  PilT protein-like  42.75 
 
 		 139 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0076  PilT protein domain protein  39.42 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  31.85 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3180  PilT domain-containing protein  39.42 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  34.06 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  35.77 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  38.97 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1964  PilT protein domain protein  36.5 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  37.04 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  33.82 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  35.25 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  38.73 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  34.25 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  33.57 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  34.56 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  36.88 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  35.51 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  32.87 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  35.46 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  36.96 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  38.3 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  33.8 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  35.66 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  33.1 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  34.27 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  33.57 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  31.94 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  34.25 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  30.94 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  33.57 
 
 		 140 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1709  PilT protein-like  33.11 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  27.54 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  31.94 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  30.94 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  30.82 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  29.6 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  30.99 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  30.99 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  30.94 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  30.99 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  31.97 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  26.4 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  32.41 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  30.82 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  32.18 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>