168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5841 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  283  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  79.43 
 
 
141 aa  233  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  70.71 
 
 
141 aa  207  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  66.42 
 
 
140 aa  190  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  64.29 
 
 
140 aa  186  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0728  PilT protein domain protein  68.57 
 
 
141 aa  184  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5519  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4674  PilT protein domain protein  67.63 
 
 
141 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  59.29 
 
 
141 aa  168  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  58.27 
 
 
139 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  57.66 
 
 
139 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  57.66 
 
 
139 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  59.85 
 
 
140 aa  165  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  57.55 
 
 
151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4334  PilT domain-containing protein  62.59 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  53.96 
 
 
139 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  52.14 
 
 
139 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  52.14 
 
 
139 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  50.71 
 
 
140 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  52.52 
 
 
138 aa  140  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  49.64 
 
 
142 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  53.28 
 
 
144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  52.52 
 
 
140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  52.52 
 
 
140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3138  PilT protein-like  51.43 
 
 
140 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464533  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2075  PilT domain-containing protein  48.57 
 
 
144 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  46.72 
 
 
142 aa  130  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  45.65 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  44.53 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  49.29 
 
 
140 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  43.57 
 
 
159 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  43.8 
 
 
140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  42.75 
 
 
139 aa  116  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  43.17 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  44.6 
 
 
138 aa  114  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  44.29 
 
 
139 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  40.71 
 
 
142 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  41.61 
 
 
145 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  41.61 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  41.61 
 
 
145 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  42.34 
 
 
145 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  47.83 
 
 
137 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  40.58 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  43.48 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  43.07 
 
 
137 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  40.88 
 
 
144 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  43.97 
 
 
151 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  40.71 
 
 
141 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2640  PilT domain-containing protein  39.42 
 
 
139 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  38.57 
 
 
140 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  48.94 
 
 
146 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1876  plasmid stabilization protein StbB-like  41.01 
 
 
139 aa  101  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417395  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  41.91 
 
 
147 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  40.58 
 
 
140 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  37.41 
 
 
141 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  39.42 
 
 
139 aa  99  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0792  nucleic acid binding protein  42.86 
 
 
155 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3180  PilT domain-containing protein  45.26 
 
 
141 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4151  PilT protein-like  43.97 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  35.29 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1710  PilT domain-containing protein  40.29 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164761  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0076  PilT protein domain protein  37.86 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  37.23 
 
 
143 aa  94  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  38.03 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1964  PilT protein domain protein  38.69 
 
 
141 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  40.14 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  41.43 
 
 
137 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  38.19 
 
 
150 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  40.74 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  32.61 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  39.71 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  37.68 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0805  PilT protein-like  41.43 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  39.31 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  39.71 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  35.71 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  36.62 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  36.62 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  36.62 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  38.03 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  37.41 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  37.32 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  34.72 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  39.86 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  40.69 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  38.3 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  39.16 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4712  Serine O-acetyltransferase  37.72 
 
 
209 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1397  PilT protein-like  35.71 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00639192  normal  0.0193425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  35.21 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  35.33 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  34.75 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  35.76 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  35.51 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  32.41 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  38.1 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  32.17 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  35.51 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  36.3 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  33.79 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  33.1 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>