201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0155 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  100 
 
 
139 aa  288  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  50.36 
 
 
139 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  34.97 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  34.81 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  34.56 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  36.03 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  36.57 
 
 
134 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  37.41 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  37.86 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  36.69 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  37.5 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  35.29 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  34.53 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  36.96 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  35.07 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0076  PilT protein domain protein  33.81 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  35.25 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  35.29 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  35.25 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  33.81 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  35.25 
 
 
132 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  34.85 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  36.03 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  33.58 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  35.2 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  32.12 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  33.82 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  37.04 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  35.21 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  33.33 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  33.33 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  35.66 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  37.21 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  32.35 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  36.22 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  33.58 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  33.1 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  34.06 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1876  PilT protein domain protein  31.58 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  31.16 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  32.61 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  34.33 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  33.08 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  33.58 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  33.09 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  35.66 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  32.86 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  33.85 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  34.31 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  34.13 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4151  PilT protein-like  33.09 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  31.39 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  33.58 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  35.43 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  34.07 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  33.07 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  34.53 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  33.33 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  31.11 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  30.88 
 
 
132 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  31.43 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  28.89 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2597  PilT protein-like protein  35.82 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  34.59 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  31.88 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  31.88 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  30.43 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  34.31 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  32.61 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  31.43 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  33.07 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  36.51 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  36.81 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  32.59 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  30.99 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0234  PilT domain-containing protein  34.04 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  30.15 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  28.17 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  31.15 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  32.85 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  33.33 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  28.68 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  28.68 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  32.61 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  29.63 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>