174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1048 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  100 
 
 		 109 aa  225  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  47.1 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  46.38 
 
 		 144 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  55.56 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  42.34 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  34.53 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  43.82 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  37.5 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  35.82 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  34.31 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3180  PilT domain-containing protein  44.76 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  34.29 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  40.91 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  40.45 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  34.86 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4151  PilT protein-like  33.09 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  33.81 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  41.76 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  30.88 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  42.42 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  36.79 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  39.22 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  31.39 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  36.9 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  43.84 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  31.39 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  29.5 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  36.56 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  31.21 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  35.78 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  31.91 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  32.97 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  40.45 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  28.26 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  41.56 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  28.26 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  35.56 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  28.68 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  36.36 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  39.33 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  36.36 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  37.08 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  37.37 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  43.53 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  39.74 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1876  plasmid stabilization protein StbB-like  32.85 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  26.67 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  42.65 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  34.07 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1710  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  29.93 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  32.58 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  35.56 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  36.36 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  24.82 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  33.33 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0076  PilT protein domain protein  31.87 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  38.1 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  40.22 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  28.79 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  56.25 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  40.91 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  36.36 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0805  PilT protein-like  34.26 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1964  PilT protein domain protein  31.39 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  26.81 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  40.91 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  38.24 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  28.79 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  26.52 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  32.32 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  39.56 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  25.53 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  26.92 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  34.52 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  27.74 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  28.79 
 
 		 134 aa  47.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  40.35 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  29.63 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  39.19 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  39.06 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  29.23 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0728  PilT protein domain protein  36.36 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  40.32 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  25 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  38.57 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  38.57 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  38.57 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>