70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3850 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3850  putative plasmid stabilization protein  100 
 
 		 144 aa  287  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9108  pilT protein, N-terminal  36.99 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  35.07 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  33.08 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  33.09 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  32.39 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  33.59 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  35.07 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2018  PilT domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0657956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  34.35 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  32.82 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  33.59 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  33.83 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  32.35 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  30.83 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  34.81 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  34.07 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  32.03 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  31.58 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  35.25 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3420  PilT protein domain protein  33.59 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.753141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  29.77 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  30.94 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  35.66 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  30.83 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  34.59 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  34.4 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  33.09 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  34 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  29.32 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  31.58 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  29.2 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  29.85 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  29.55 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  31.39 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  32.12 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  28.47 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  30 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  30 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  29.93 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  30.43 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3556  PilT domain-containing protein  35.17 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  23.36 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  26.21 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  31.75 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  28.08 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  31.06 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  30.15 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  28.99 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0792  nucleic acid binding protein  27.73 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1397  PilT protein-like  25.95 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00639192  normal  0.0193425 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  29.79 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3138  PilT protein-like  33.33 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464533  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  32.09 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  29.9 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  24.49 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  29.9 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>