217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4014 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  52.99 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  35.77 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  35.51 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  36.96 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  34.31 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  34.72 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  33.8 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  35.17 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  34.53 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  34.53 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  34.51 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  35.07 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  35.92 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  29.85 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  33.56 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  32.12 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  34.29 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  32.84 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  37.5 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  36.69 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  35.51 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  32.89 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  32.59 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  31.65 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  30.22 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  32.62 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  32.61 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  32.88 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  34.31 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  29.63 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  34.53 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  32.62 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  32.35 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  31.11 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  29.86 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  28.78 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  30.37 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  30.37 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  31.88 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  32.09 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  32.37 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  28.15 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  32.09 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  31.88 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  34.53 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  32.12 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  33.58 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  31.58 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  36.11 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  32.37 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  30.6 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  31.21 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  27.78 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  32.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  35.92 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  30.15 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  31.3 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  30.15 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  32.14 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  30 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  30.15 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  32.39 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  31.62 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  33.09 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  31.62 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  32.14 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  33.87 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  32.14 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  32.14 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  29.55 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  32.09 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  36.61 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  29.32 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  26.28 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  30.22 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  29.32 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3942  PilT protein domain protein  29.14 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  30.15 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  34.07 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  30.66 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  26.09 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  40.22 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  29.17 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  32.63 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  30.08 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  32.41 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>