97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1430 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  238  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  94.34 
 
 
136 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  94.34 
 
 
136 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  94.34 
 
 
136 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  92.45 
 
 
136 aa  200  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  85.34 
 
 
136 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  58.82 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  48.54 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  49.53 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  49.53 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  49.53 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  45.79 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  45.37 
 
 
150 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  47.12 
 
 
145 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  46.23 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  45.79 
 
 
143 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  44.86 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  46.15 
 
 
137 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  44.66 
 
 
136 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  47.17 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  43.81 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  43.69 
 
 
136 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  44.34 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  43.93 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  43.69 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  43.4 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  40.78 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3420  PilT protein domain protein  44.23 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.753141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  41.9 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  40.2 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  44.76 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  38.32 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  38.1 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  36.79 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  40.19 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  39.81 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  38.68 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  37.5 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  38.32 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  38.74 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1709  PilT protein-like  31.78 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  36.7 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  37.74 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1397  PilT protein-like  37.38 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00639192  normal  0.0193425 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  35.92 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  37.38 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  39.25 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  37.38 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0576  PilT protein-like  34.23 
 
 
121 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  32.41 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  34.58 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  36.45 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9108  pilT protein, N-terminal  35.58 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  35.19 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  34.91 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3526  PilT domain-containing protein  31.78 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318163  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  31.82 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3850  putative plasmid stabilization protein  34 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2018  PilT domain-containing protein  34.91 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0657956  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  32.41 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0141  PilT protein-like  40.19 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3379  PilT domain-containing protein  39.62 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  34.26 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  32.14 
 
 
140 aa  50.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  32.73 
 
 
139 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  33.63 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  34.86 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  36.45 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  35.78 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  36.45 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  31.82 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  43.33 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1592  hypothetical protein  46.3 
 
 
93 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  30.63 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  33.03 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1511  hypothetical protein  62.86 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162159  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  30.91 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  35.42 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3556  PilT domain-containing protein  35.92 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  28.04 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  32.73 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  30.89 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  33.64 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  29.47 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  32.11 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  29.36 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  35.45 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4712  Serine O-acetyltransferase  32.56 
 
 
209 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  31.48 
 
 
151 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0728  PilT protein domain protein  29.31 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5519  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  30.51 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  35 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  27.68 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  32.14 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  36 
 
 
127 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>