91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0576 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0576  PilT protein-like  100 
 
 		 121 aa  240  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  52.25 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  48.7 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  48.7 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  49.55 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3526  PilT domain-containing protein  45.79 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1709  PilT protein-like  43.93 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3379  PilT domain-containing protein  44.44 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0141  PilT protein-like  46.15 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  37.72 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  36.52 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  36.44 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  34.78 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  36.44 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  35.59 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  40 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  37.84 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  34.23 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  35.96 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  37.17 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  35.09 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  36.45 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  32.71 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  33.02 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  33.96 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  40.91 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  36.36 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  33.64 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  40.57 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  32.76 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  36.61 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  40.74 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  32.74 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  36.21 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3420  PilT protein domain protein  31.86 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.753141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  37.07 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  33.03 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  28.81 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  35.14 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  32.08 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  35.14 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  33.64 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  29.57 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  30.43 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  31.67 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  32.79 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  32.74 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9108  pilT protein, N-terminal  30.83 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  33.64 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  31.53 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  31.86 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  32.11 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  32.11 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  30.91 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  30.09 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  31.3 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  29.73 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  29.73 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  31.09 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  27.43 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  34.58 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  31.19 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  33.04 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  32.38 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  30.19 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  37.35 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  30.28 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1397  PilT protein-like  47.22 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00639192  normal  0.0193425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  30.28 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  30.09 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  32.71 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0805  PilT protein-like  33.33 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  35.79 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  31.48 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  33.03 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  34.82 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4130  hypothetical protein  33.82 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3556  PilT domain-containing protein  29.57 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  30.09 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3138  PilT protein-like  34.55 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464533  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  30.48 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  33.64 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  33.94 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  32.99 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>