116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1183 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  100 
 
 		 119 aa  239  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  41.59 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0058  PilT protein domain protein  40 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0223117  normal  0.362621 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  41.84 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  34.78 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  41.84 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  41.05 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  40.21 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  40.43 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  37.07 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  39.8 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  36.28 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  36.28 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  38.78 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  36.17 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  35.65 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  36 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  33.62 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  36.73 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  38.54 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  39.8 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  31.86 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  31.91 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  32.67 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  36.46 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  27.59 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  28.85 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4829  PilT protein domain protein  34.21 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  30.09 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  32.32 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  31.63 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  32.99 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  31.73 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  31.73 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  31.97 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  36.96 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0397  PilT protein-like  28.72 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  29.17 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  37.25 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  33.7 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  30.17 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  34.04 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  34.04 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  29.79 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  31.52 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  30.85 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  27.59 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  35.48 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  31.91 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4600  putative nitrogen regulatory protein (NtrR-like), putative virulence associated protein (vap)  39.8 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.660475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1675  PilT domain-containing protein  34.48 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  32 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  32.48 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1681  PilT protein-like  39.78 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116331  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0908  PilT domain-containing protein  28.28 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  27.84 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  27.84 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4042  PilT protein domain protein  33 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  34.21 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  32.26 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  27.66 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  30.61 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  31.48 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  32.29 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  27.62 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  33 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  27.37 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  29.73 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  26.89 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  32.65 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  28.44 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  26.89 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  34.21 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  29.82 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1702  PilT domain-containing protein  29.17 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  32.98 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0234  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  40.98 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  29.91 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  40.91 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  28.87 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  32.26 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  31.25 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  30.53 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  32.17 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  35.48 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3304  PilT protein domain protein  41.94 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  35.59 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  29.66 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2617  nucleic acid binding protein  31.33 
 
 		 134 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  36.73 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  36.84 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>