71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0141 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0141  PilT protein-like  100 
 
 		 118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3379  PilT domain-containing protein  88.89 
 
 		 144 aa  191  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  56.78 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  51.67 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  50.85 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  48.74 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0576  PilT protein-like  46.15 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1709  PilT protein-like  40.19 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3526  PilT domain-containing protein  40.19 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  44.14 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  40.37 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  45.05 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  40.57 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  41.67 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  40.57 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  40.54 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  40.57 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  41.67 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  37.74 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  40.19 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  40 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  35.78 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  40.74 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  39.32 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  36.67 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  34.21 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  39.25 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  37.96 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  37.96 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  37.96 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  38.68 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  30.84 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  38.74 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  31.82 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  37.74 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  35.85 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  38.68 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  34.82 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  31.86 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  31.03 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  37.04 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  31.43 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  33.02 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  39.09 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2018  PilT domain-containing protein  35.4 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0657956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  28.83 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  29.06 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  31.36 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  36.45 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  31.48 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  34.45 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  34.91 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  37.14 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  32.46 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  34.23 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  32.14 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  32.14 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  31.86 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  33.62 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  31.86 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  31.82 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  32.43 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  33.03 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  34.86 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  31.43 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  29.73 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  31.43 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  31.9 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>