94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2018 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2018  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0657956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9108  pilT protein, N-terminal  52.41 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  42.45 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  44.2 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  38.85 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  40.29 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  40.29 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  40.29 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  38.13 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4008  putative PilT-like protein  35.14 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  35.07 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0679  putative plasmid stability protein  38.57 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.536522  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  35.92 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  36.23 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  39.42 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1602  PilT protein-like  34.31 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3163  PilT protein domain protein  37.68 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.732092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  36.17 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  36.23 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3420  PilT protein domain protein  37.31 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.753141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  33.33 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  34.29 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  32.14 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4543  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  35.21 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1213  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  32.59 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1526  PilT protein domain protein  33.81 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3850  putative plasmid stabilization protein  36.11 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  34.29 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  36.81 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4336  PilT protein-like  33.33 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2084  PilT protein-like protein  35.04 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  31.65 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  32.39 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  30.56 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  33.09 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  32.12 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  35.62 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  31.47 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1709  PilT protein-like  32.62 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  31.43 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  32.39 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  35.81 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  31.88 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1397  PilT protein-like  32.12 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00639192  normal  0.0193425 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  32.17 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  28.47 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3379  PilT domain-containing protein  35.37 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0721689  normal  0.597775 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  32.62 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  35.81 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1430  hypothetical protein  34.91 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  31.03 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  31.91 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  30.08 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  31.72 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3556  PilT domain-containing protein  34.51 
 
 		 165 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  30.22 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  30.94 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  31.47 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  31.47 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  29.79 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  36.11 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  30.56 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  31.47 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  30.28 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  28.47 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3526  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.318163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  29.79 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  29.79 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  32.41 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  29.08 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  32.41 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  30.15 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  29.58 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1592  hypothetical protein  42.62 
 
 		 93 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.488215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  31.25 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0076  PilT protein domain protein  30.56 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  28.46 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  32.41 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  32.41 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>