42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0656 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  100 
 
 		 126 aa  247  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  36.97 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  37.39 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  38.14 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  34.11 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  37.29 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  36.67 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  37.29 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  37.29 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  30.58 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  33.64 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  37.7 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1201  PilT protein-like  34.91 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0955216  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  31.97 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2018  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0657956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  32.2 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  33.02 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6277  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.466445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  35.56 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1390  PilT domain-containing protein  31.65 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  31.25 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  33.04 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2647  PilT domain-containing protein  34.21 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434907  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  27.86 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  35.05 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  27.74 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  26.77 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  29.06 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  25.55 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  26.09 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  27.74 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  31.53 
 
 		 126 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9108  pilT protein, N-terminal  52.94 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  24.81 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  39.66 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  33.9 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  32.81 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  26.67 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  29.75 
 
 		 137 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>