25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1367 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  100 
 
 		 126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  46.03 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1201  PilT protein-like  50.77 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0955216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  45.08 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  41.32 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  41.32 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  42.86 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  41.32 
 
 		 121 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  43.55 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  37.7 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  40.35 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  29.51 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  31.67 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  31.62 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  34.78 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3589  PilT protein domain protein  32.99 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  28.24 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  25.56 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  31.53 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  25.19 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  32.26 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  32.26 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  30.48 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  25.19 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>