44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1389 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  38.79 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  42.05 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  35.65 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  36.67 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  35.25 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  33.64 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3765  PilT protein domain protein  32.74 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  32.74 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  29.73 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  30.77 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  29.73 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  31.86 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  29.73 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  29.73 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  31.86 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  31.71 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  33 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  29.51 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  28.69 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2647  PilT domain-containing protein  30.65 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434907  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  26.98 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  26.23 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  29.13 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  31.2 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  29.06 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  27.78 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5837  PilT domain-containing protein  24.62 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.380144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  51.22 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4465  PilT domain-containing protein  24.62 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3902  PilT domain-containing protein  24.62 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3903  PilT protein-like  24.62 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  30.3 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  28.93 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  28.89 
 
 		 141 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  28.03 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  29.84 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4364  PilT domain-containing protein  24.62 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  28.79 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  29.69 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>