32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1142 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  100 
 
 		 121 aa  250  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  58.68 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  58.68 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  58.68 
 
 		 121 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  57.02 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  55.37 
 
 		 121 aa  136  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  48.76 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  42.86 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1201  PilT protein-like  39.67 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0955216  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  41.96 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  38.39 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  33.64 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  34.21 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  30.91 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  30.77 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  34.15 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  34.15 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  37.04 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  28.3 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  30.19 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  32.48 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  29.06 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  33.02 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  26.61 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  30.25 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  28.83 
 
 		 133 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  28.46 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1534  PilT domain-containing protein  26.61 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.281833  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  31.71 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2647  PilT domain-containing protein  31.13 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  29.29 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>