28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0681 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  256  6e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  46.15 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  36.29 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3765  PilT protein domain protein  38.39 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  38.05 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  38.53 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  36.36 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  34.21 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2647  PilT domain-containing protein  40.91 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434907  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  33.02 
 
 		 126 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  31.86 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  33.98 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  33.93 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0857  hypothetical protein  50 
 
 		 54 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  35.42 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  34.26 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  31.09 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  27.36 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  34.78 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  28.81 
 
 		 125 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  30.89 
 
 		 140 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  31.94 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  25 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1400  PilT protein domain protein  28.79 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.310156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>