58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2498 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  100 
 
 		 136 aa  273  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  38.21 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1436  hypothetical protein  36.64 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000042166  normal  0.0228273 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  36.13 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  35.97 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  35.77 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  35.61 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  35.61 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  30.89 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  34.65 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  35.61 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  32.8 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3135  PilT domain-containing protein  28.33 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1201  PilT protein-like  34.21 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0955216  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  30.89 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  35.43 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  31.75 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  34.11 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  32.52 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  32.52 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  32.14 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  29.92 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4042  PilT protein domain protein  31.76 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  31.76 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  32.28 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  25.95 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  32.17 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  29.85 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0226  PilT protein-like protein  25.93 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.562188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  26.72 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  32.48 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  28.35 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  29.01 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  29.82 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  30.77 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  28.03 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3688  PilT protein domain protein  30.22 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  32.33 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  26.77 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  28.78 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1916  PilT protein-like  27.73 
 
 		 144 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  29.71 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 129 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  31.2 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  27.82 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  26.61 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1837  PilT protein-like protein  28.28 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0877816  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  32.67 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  33.9 
 
 		 126 aa  40.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  29.92 
 
 		 130 aa  40  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  25.78 
 
 		 135 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>