15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3765 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3765  PilT protein domain protein  100 
 
 		 133 aa  271  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  37.07 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  38.39 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  39.6 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  32.74 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  32.17 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  28.16 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2647  PilT domain-containing protein  36.52 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434907  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  29.91 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  30 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  26.32 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  28.1 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  28.1 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  28.1 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>