46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2647 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2647  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  244  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434907  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  44.54 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  40.91 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3765  PilT protein domain protein  36.52 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  37 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  35.45 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  38.94 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  30.65 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  35.96 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  35.77 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  36.52 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  31.48 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  30.66 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  31.13 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  28.33 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  29.46 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1915  hypothetical protein  43.08 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.667469  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  28.15 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  31.5 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  30.39 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  30.1 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  30.1 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  31.09 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  29.23 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  31.09 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  30 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2280  PilT protein domain protein  27.5 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.234231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  29.55 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0151  PilT protein domain protein  26.87 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.85559  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  32.06 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  31.48 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  29.92 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0178  PilT protein domain protein  30.53 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.110884 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 132 aa  42  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  25.44 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  29.91 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  31.3 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  28.91 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  32.14 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  29.32 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  30.09 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  25.4 
 
 		 133 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  31.75 
 
 		 155 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>