38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1062 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  100 
 
 		 121 aa  243  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  57.85 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  57.85 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  57.02 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1142  nucleic acid-binding protein  57.02 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2082  PilT protein domain protein  56.3 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.951724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  52.89 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1201  PilT protein-like  46.28 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0955216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1367  PilT protein-like protein  46.03 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  46.9 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  38.14 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  35.96 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  36.8 
 
 		 126 aa  57  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6219  PilT protein domain protein  37.84 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.314877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  37.72 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  37.72 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1114  nucleic acid binding protein  48.1 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  31.86 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  28.83 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1663  PilT protein-like  31.48 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0881523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  32.17 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3135  PilT domain-containing protein  28.35 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  35.42 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3131  PilT protein domain protein  32.38 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1554  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.19075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  31.67 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  34.23 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  34.23 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0679  PilT protein-like  31.3 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163156  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  28.83 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2106  PilT domain-containing protein  32.41 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  27.93 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  31.9 
 
 		 132 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  29.69 
 
 		 134 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0252  PilT protein-like  36.11 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  30.88 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  31.85 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  28.79 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>