15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3135 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3135  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 129 aa  268  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  35.29 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  35.29 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  34.43 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  34.48 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  28.33 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  30.83 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1062  PilT protein-like  28.35 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  25.6 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  24.06 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4062  PilT protein domain protein  26.67 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>