31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11426 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  42.4 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  34.68 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  33.6 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  33.6 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3135  PilT domain-containing protein  34.48 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1526  PilT protein-like  36.36 
 
 
129 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000713835  decreased coverage  0.00911334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  37.8 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  29.75 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0656  nucleic acid binding protein  33.33 
 
 
126 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  35.43 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  32.54 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  30 
 
 
126 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0681  hypothetical protein  31.09 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000394475  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  39.39 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  29.77 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  32.35 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3431  PilT domain-containing protein  33.62 
 
 
121 aa  43.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4274  PilT protein-like  33.62 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4092  PilT domain-containing protein  33.62 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3572  PilT protein domain protein  30.23 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  32.67 
 
 
148 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  32.56 
 
 
140 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  37.82 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1443  PilT domain-containing protein  29.01 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0125509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1382  hypothetical protein  29.01 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000499389  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0058  PilT protein domain protein  36.36 
 
 
118 aa  41.2  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0223117  normal  0.362621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0718  hypothetical protein  39.44 
 
 
578 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  31.54 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  25.42 
 
 
137 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>