64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4420 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  100 
 
 		 128 aa  259  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  37.9 
 
 		 133 aa  87  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  34.78 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  30.43 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  29.75 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  30.16 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  34.04 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  31.75 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  30.89 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0188  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  31.11 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  30.33 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  25.86 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  32.03 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1675  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215959 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  26.98 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  22.76 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  30.34 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4600  putative nitrogen regulatory protein (NtrR-like), putative virulence associated protein (vap)  34.41 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.660475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  26.52 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  28.15 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  32 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4829  PilT protein domain protein  28 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0091  PilT protein-like  37.14 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  27.78 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  26.4 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4050  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  27.48 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  29.23 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0058  PilT protein domain protein  28.89 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0223117  normal  0.362621 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  25.2 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  30.4 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  26.4 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  24.8 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2810  PilT protein domain protein  28.57 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0262171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  30 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  26.02 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  28.36 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2655  PIN domain protein  23.58 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  26.77 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  29.23 
 
 		 138 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  28 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  25 
 
 		 133 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  27.2 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  28.35 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  28.09 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  30 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  26.36 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1526  PilT protein-like  25.98 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000713835  decreased coverage  0.00911334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  26.61 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  25.98 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  32.98 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  30.23 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  29.79 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  30.95 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  28.12 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0051  PilT domain-containing protein  30.17 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.330837 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  28.12 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 128 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>