26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1751 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  100 
 
 
131 aa  269  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  31.54 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  30.43 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  34.96 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  32.33 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  34.43 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  33.86 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  31.36 
 
 
130 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0589  PilT protein domain protein  30.6 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.663237  normal  0.0136168 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  33.88 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0598  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 
136 aa  52  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0817305  normal  0.249428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0946  PilT domain-containing protein  30.53 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1454  PilT protein-like  28.89 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  29.57 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  34.17 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  34.17 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0411  PilT domain-containing protein  34.55 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  32.5 
 
 
131 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0073  PilT domain-containing protein  31.06 
 
 
125 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  30.77 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1526  PilT protein-like  31.18 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000713835  decreased coverage  0.00911334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  29.25 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  27.48 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  31.09 
 
 
133 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  26.67 
 
 
131 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0197  PilT domain-containing protein  30.17 
 
 
126 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>