125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0983 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  100 
 
 
133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  37.9 
 
 
128 aa  87  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  32.03 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  33.59 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  32.81 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  32.2 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  39.78 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  32.81 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  32.03 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  29.37 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  30.71 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  30.47 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2640  PilT domain-containing protein  35.71 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  31.2 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1437  hypothetical protein  48.98 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238357  normal  0.0222141 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  32.54 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  30.71 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  29.69 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  31.75 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  29.46 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0234  PilT domain-containing protein  28.46 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  29.23 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  30.53 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  30.65 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  29.77 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  32.82 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  32.69 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  29.32 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  28.12 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4425  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 
134 aa  52  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  32.58 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  32.54 
 
 
133 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  28.12 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4600  putative nitrogen regulatory protein (NtrR-like), putative virulence associated protein (vap)  31.54 
 
 
135 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.660475  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  30.16 
 
 
133 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  33.86 
 
 
133 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  30.65 
 
 
129 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  28.23 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  28.99 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2391  PIN (PilT N terminus) domain  33.7 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  30.47 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  28.12 
 
 
132 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  24.81 
 
 
135 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  34.51 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  27.78 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0908  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  30.47 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  28.12 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  30.08 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  32.06 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  29.57 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  34.04 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2810  PilT protein domain protein  32.26 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0262171  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  31.25 
 
 
138 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  31.18 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  34.04 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10638  hypothetical protein  32 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000594146  normal  0.603416 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  28.91 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  29.58 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  26.32 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  32.28 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  26.56 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1964  PilT protein domain protein  30.4 
 
 
141 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  29.2 
 
 
138 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  31.91 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  30.66 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1876  plasmid stabilization protein StbB-like  33.86 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417395  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2659  nucleic acid binding protein  26.72 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.234415  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  29.69 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  32.03 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  24.8 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  31.5 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  29.79 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  32.37 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  30.22 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  27.78 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  27.2 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  26.4 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  28.57 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  28.57 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  26.98 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1876  PilT protein domain protein  29.37 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1709  PilT protein-like  25.69 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  27.66 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  28.03 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3456  PilT protein domain protein  29.93 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  29.93 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  29.2 
 
 
139 aa  43.5  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  26.98 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1681  PilT protein-like  30.6 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116331  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1710  PilT domain-containing protein  30.66 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164761  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  30.94 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0305  PilT protein domain protein  30 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0032427  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  28 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0141  plasmid maintenance protein VagD  30.08 
 
 
138 aa  42.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  27.97 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0017  PilT domain-containing protein  29.27 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.461831  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2655  PIN domain protein  31.46 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>