25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0280 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  268  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  43.85 
 
 		 135 aa  106  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0666  hypothetical protein  59.3 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.001899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  40.8 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  34.81 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  36.8 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  36.15 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  35.25 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  36.84 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  38.71 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  34.38 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  35.34 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  38.33 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  32.8 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  33.86 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  37.1 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  29.6 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  31.67 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  31.3 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  33.88 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0946  PilT domain-containing protein  34.43 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0598  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0817305  normal  0.249428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0589  PilT protein domain protein  33.07 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.663237  normal  0.0136168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>