20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3708 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  100 
 
 		 129 aa  254  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  52 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  44.19 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  42.06 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  42.64 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  41.09 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  43.41 
 
 		 131 aa  98.2  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  39.68 
 
 		 133 aa  94.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  41.6 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  42.06 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  39.69 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  35.16 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  35.94 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  38.52 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  34.96 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  33.86 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  35.16 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  31.75 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  29.55 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0666  hypothetical protein  32.53 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.001899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>