20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0550 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  100 
 
 		 130 aa  266  5.9999999999999995e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  61.11 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  55.12 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  49.61 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  47.24 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  48.8 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  48.06 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  44.96 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  41.09 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  34.62 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  36.8 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  31.54 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  32.8 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  29.92 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  31.25 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  29.91 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  27.56 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  26.15 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0197  PilT domain-containing protein  45.45 
 
 		 126 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  30.33 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>