23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2435 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  100 
 
 		 132 aa  263  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  48 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  47.2 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  52 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  48.8 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  42.4 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  46.88 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  40.8 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  40.8 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  37.7 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  30.95 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  34.38 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  35.83 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  30.58 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  32.23 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  33.6 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  30.53 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0666  hypothetical protein  35 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.001899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0657  PilT protein domain protein  31.15 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 131 aa  43.5  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  26.32 
 
 		 134 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0598  PilT domain-containing protein  29.46 
 
 		 136 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0817305  normal  0.249428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0589  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.663237  normal  0.0136168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>