19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0589 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0589  PilT protein domain protein  100 
 
 
136 aa  273  5e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.663237  normal  0.0136168 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0598  PilT domain-containing protein  98.53 
 
 
136 aa  270  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0817305  normal  0.249428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 
131 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  32.28 
 
 
132 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  35.43 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  33.82 
 
 
134 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12566  hypothetical protein  31.93 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.342692  normal  0.114809 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  33.86 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  31.36 
 
 
131 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0946  PilT domain-containing protein  27.74 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  29.69 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  28 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  29.46 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  28.81 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  32.81 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  28.68 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  29.69 
 
 
138 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  28.91 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  27.2 
 
 
125 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>