29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0232 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  100 
 
 		 135 aa  273  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  53.97 
 
 		 132 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  42.34 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  38.1 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  40.8 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0666  hypothetical protein  39.77 
 
 		 88 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.001899  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  34.33 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  33.86 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  35.83 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  36.15 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  36.51 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  35.16 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  31.36 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  34.85 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  32.5 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  29.46 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  29.91 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0946  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  28.81 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0598  PilT domain-containing protein  36.22 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0817305  normal  0.249428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  31.36 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0589  PilT protein domain protein  35.43 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.663237  normal  0.0136168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10231  hypothetical protein  32.03 
 
 		 226 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1454  PilT protein-like  29.55 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12770  hypothetical protein  32.29 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3760  PilT protein domain protein  28.79 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383915  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12547  hypothetical protein  32.26 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0120006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>