21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12770 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12770  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  283  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2779  PilT protein domain protein  48.91 
 
 
141 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156737  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10231  hypothetical protein  45.26 
 
 
226 aa  105  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7130  PilT domain-containing protein  45.87 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428024  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0935  PilT protein domain protein  40.77 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.827464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0087  PilT protein domain protein  38.46 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12566  hypothetical protein  37.78 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.342692  normal  0.114809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10307  hypothetical protein  42.42 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000112369  normal  0.0967595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5190  PilT domain-containing protein  43.18 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.745864  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5559  PilT domain-containing protein  39.39 
 
 
136 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.966422  normal  0.472394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2785  PilT protein domain protein  37.4 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.030495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4093  PilT protein domain-containing protein  31.75 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1339  hypothetical protein  39.44 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12547  hypothetical protein  35.71 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0120006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8889  hypothetical protein  40.35 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  32.29 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3760  PilT protein domain protein  40 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383915  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3390  hypothetical protein  32.59 
 
 
137 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4362  PilT protein domain protein  32.14 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151673  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  28.46 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0521  hypothetical protein  29.11 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.281693  normal  0.161001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>