18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4093 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4093  PilT protein domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10669  hypothetical protein  58.82 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7412  hypothetical protein  42.17 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12770  hypothetical protein  31.75 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10307  hypothetical protein  36.62 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000112369  normal  0.0967595 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10231  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0521  hypothetical protein  32.91 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.281693  normal  0.161001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0087  PilT protein domain protein  32 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7130  PilT domain-containing protein  44.83 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1339  hypothetical protein  54 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8949  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234545  normal  0.589918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5190  PilT domain-containing protein  32.76 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.745864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2779  PilT protein domain protein  31.15 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156737  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0935  PilT protein domain protein  34.43 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.827464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12566  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.342692  normal  0.114809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3760  PilT protein domain protein  31.62 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383915  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5559  PilT domain-containing protein  31.09 
 
 		 136 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.966422  normal  0.472394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8889  hypothetical protein  48.78 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>