16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5190 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5190  PilT domain-containing protein  100 
 
 
137 aa  275  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.745864  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5559  PilT domain-containing protein  71.32 
 
 
136 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.966422  normal  0.472394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10307  hypothetical protein  65.12 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000112369  normal  0.0967595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2785  PilT protein domain protein  64.34 
 
 
141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.030495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0935  PilT protein domain protein  57.46 
 
 
137 aa  156  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.827464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7130  PilT domain-containing protein  53.85 
 
 
159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428024  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12770  hypothetical protein  43.18 
 
 
138 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10231  hypothetical protein  41.79 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0087  PilT protein domain protein  41.48 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2779  PilT protein domain protein  34.62 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1339  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12566  hypothetical protein  32.56 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.342692  normal  0.114809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12547  hypothetical protein  35.54 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0120006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4093  PilT protein domain-containing protein  32.76 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3760  PilT protein domain protein  31.4 
 
 
148 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383915  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7412  hypothetical protein  58.33 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>