19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2779 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2779  PilT protein domain protein  100 
 
 		 141 aa  273  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156737  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12770  hypothetical protein  48.91 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10231  hypothetical protein  42.96 
 
 		 226 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12566  hypothetical protein  41.91 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.342692  normal  0.114809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0087  PilT protein domain protein  45.97 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10307  hypothetical protein  39.69 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000112369  normal  0.0967595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1339  hypothetical protein  45.95 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7130  PilT domain-containing protein  38.94 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0935  PilT protein domain protein  38.64 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.827464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3390  hypothetical protein  34.07 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4362  PilT protein domain protein  34.31 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5190  PilT domain-containing protein  34.62 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.745864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5559  PilT domain-containing protein  37.12 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.966422  normal  0.472394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2785  PilT protein domain protein  39.58 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.030495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12547  hypothetical protein  35.54 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0120006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0521  hypothetical protein  37.7 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.281693  normal  0.161001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3760  PilT protein domain protein  31.34 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383915  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4093  PilT protein domain-containing protein  31.15 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8889  hypothetical protein  35.06 
 
 		 98 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>