31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1159 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  100 
 
 
132 aa  271  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  53.97 
 
 
135 aa  144  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  42.5 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  40.3 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  40.16 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  36.8 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  35.11 
 
 
130 aa  76.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  33.85 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  35.21 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0666  hypothetical protein  40.74 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.001899  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  34.96 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  30.58 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  31.54 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  30.08 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  29.92 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0598  PilT domain-containing protein  33.07 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0817305  normal  0.249428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 
133 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  32.09 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  30.51 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  31.5 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0589  PilT protein domain protein  32.28 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.663237  normal  0.0136168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10231  hypothetical protein  34.17 
 
 
226 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  28.35 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  28.57 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  27.42 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  27.78 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12770  hypothetical protein  28.46 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  30.71 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0521  hypothetical protein  38.71 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.281693  normal  0.161001 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2810  PilT protein domain protein  28.81 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0262171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>