25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4104 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  100 
 
 		 140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  38.81 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  40.3 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  41.6 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  39.69 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  38.1 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  38.14 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  37.7 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  34.81 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  34.62 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  40.68 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  34.65 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  34.71 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  38.4 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  32.58 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  30 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  30.58 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  30.58 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0666  hypothetical protein  31.82 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.001899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0599  PilT domain-containing protein  27.73 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1454  PilT protein-like  29.01 
 
 		 139 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  31.09 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  32.54 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  29.25 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>