19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4984 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  100 
 
 		 139 aa  283  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  50.4 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  39.69 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  38.4 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  33.08 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  36.15 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  31.67 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  29.41 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  31.45 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  30.25 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  31.5 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  31.75 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  30.65 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  27.27 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  29.77 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1454  PilT protein-like  28.46 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0946  PilT domain-containing protein  32.2 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  30.89 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.533625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>