22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1884 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  50.77 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  47.33 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  48.82 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  47.2 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  48.09 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  52.38 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  48.06 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  44.19 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  35.16 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  35.25 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  32.81 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  32.2 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  30.58 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  29.92 
 
 		 132 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  33.33 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  29.41 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  31.36 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  28.93 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0946  PilT domain-containing protein  25.37 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  32.5 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0666  hypothetical protein  35.53 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.001899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>