20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0838 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  100 
 
 
131 aa  257  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  61.11 
 
 
130 aa  150  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  52.38 
 
 
131 aa  133  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  52.31 
 
 
133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  52.38 
 
 
131 aa  124  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  48.41 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  50 
 
 
131 aa  114  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  46.88 
 
 
132 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  42.06 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  40.68 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  38.33 
 
 
133 aa  67  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  35.83 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  34.92 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  37.7 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  30.51 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0197  PilT domain-containing protein  56.82 
 
 
126 aa  50.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  31.36 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  31.97 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  30.89 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  29.55 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>