20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0413 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  100 
 
 		 133 aa  273  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  64.57 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  47.33 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  46.46 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  47.24 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  48.41 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  41.22 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  40.8 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  39.68 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  35.43 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  30 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  37.1 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  35.77 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  27.2 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  30.53 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  29.46 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0666  hypothetical protein  40.51 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.001899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0197  PilT domain-containing protein  50 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>