22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2254 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  100 
 
 
133 aa  273  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  64.57 
 
 
133 aa  175  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  55.12 
 
 
130 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  50.39 
 
 
131 aa  133  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  48.82 
 
 
131 aa  130  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  52.31 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  46.46 
 
 
131 aa  114  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  42.4 
 
 
132 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  42.06 
 
 
129 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  37.69 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  32.85 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  38.71 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  31.2 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  37.31 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  30.08 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  32.5 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  29.77 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  28.1 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  26.67 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0197  PilT domain-containing protein  52.27 
 
 
126 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0946  PilT domain-containing protein  26.98 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  31.09 
 
 
131 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>