23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3128 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2254  PilT domain-containing protein  37.69 
 
 		 133 aa  84.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.366148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  38.14 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  35.16 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  37.98 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  35.11 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  34.65 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  36.84 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  33.59 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  35.16 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11593  hypothetical protein  34.59 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.69589e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  35.43 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  30.95 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  35.59 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0550  PilT protein domain protein  31.54 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0838  PilT domain-containing protein  34.92 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.533625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0990  PilT protein-like  33.9 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286661 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4984  PilT protein domain protein  31.67 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.599937  normal  0.921394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1751  PilT domain-containing protein  31.36 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0754903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0666  hypothetical protein  37.97 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.001899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4420  PilT protein domain protein  25.86 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0598  PilT domain-containing protein  30.23 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0817305  normal  0.249428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>