15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0666 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0666  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  178  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.001899  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0280  PilT domain-containing protein  59.3 
 
 
133 aa  105  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.4278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1522  PilT-like protein  40.91 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0232  PilT protein domain protein  39.77 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.363167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1159  PilT protein domain protein  40.74 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.876268  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4104  PilT protein-like  31.82 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393493  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2527  PilT protein domain protein  37.04 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2435  PilT protein-like  35 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.790296  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3128  PilT protein domain protein  37.97 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0413  PilT protein-like  40.51 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1669  PilT protein domain protein  28.75 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.47893  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3708  PilT protein domain protein  32.53 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1884  PilT domain-containing protein  35.53 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144315  normal  0.966588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0946  PilT domain-containing protein  32.47 
 
 
135 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12042  hypothetical protein  27.94 
 
 
132 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>